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16SrRNA高通量測序研究有齲者唾液微生物群落結構及多樣性

2016-03-17 來(lái)源:健客網(wǎng)社區  標簽: 掌上醫生 喝茶減肥 一天瘦一斤 安全減肥 cps聯(lián)盟 美容護膚
摘要:研究指出,人類(lèi)口腔唾液有復雜的微生物群落結構;在門(mén)水平和屬水平上,有齲者的微生物種類(lèi)較無(wú)齲者稍有減少;Firmicutes和SR1菌門(mén),Rothia、Alistipes和Catonella菌屬的存在與齲病呈負相關(guān);相反地,Scardovia等菌屬的存在與齲病呈正相關(guān)。

  近期,蘭州大學(xué)口腔醫學(xué)院修復科研究人員發(fā)表論文,旨在通過(guò)16SrRNA高通量測序研究有齲和無(wú)齲者唾液的微生物群落結構及其差異。研究指出,人類(lèi)口腔唾液有復雜的微生物群落結構;在門(mén)水平和屬水平上,有齲者的微生物種類(lèi)較無(wú)齲者稍有減少;Firmicutes和SR1菌門(mén),Rothia、Alistipes和Catonella菌屬的存在與齲病呈負相關(guān);相反地,Scardovia等菌屬的存在與齲病呈正相關(guān)。該文發(fā)表在2015年第05期《口腔醫學(xué)研究》雜志上。

  在甘肅省康樂(lè )縣景古鎮居民口腔檢查中隨機選取14位漢族居民,其中,7例有齲(caries-active,CA組,DMFT≥4)、7例無(wú)齲(caries-free,CF組)。采取唾液樣本,提DNA,PCR擴增,利用IlluminaMiseq測序平臺對16SrRNAV4區進(jìn)行雙端測序;利用Mothur、MEGAN4、Cluster3.0和JavaTreeview等軟件進(jìn)行細菌群落結構及多樣性的差異分析。

  共得到118151條優(yōu)質(zhì)序列,發(fā)現5738個(gè)OTUs,2795個(gè)物種,歸屬27個(gè)門(mén),218個(gè)屬。CA組和CF組唾液微生物群落結構有差異,其中,門(mén)水平上,Firmicutes和SR1在CA組顯著(zhù)低于CF組(P<0.05)。屬水平上,Rothia、Alistipes和Catonella在CA組顯著(zhù)低于CF組(P<0.05),Scardovia在CA組顯著(zhù)高于CF組(P<0.05);CA組和CF組OTUs分別為(550.2&plusmn;26.48),(597.4±66.07),CA組和CF組Simpson多樣性指數分別為(0.73±0.03),(0.49±0.01),均無(wú)統計學(xué)差異。

 

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