隨著(zhù)二代測序技術(shù)的發(fā)展,精準醫療行業(yè)的興起,個(gè)體化用藥、生物大數據、基因組學(xué)等概念快速形成產(chǎn)業(yè),在不斷摸索和積累中成長(cháng)。
對于“精準醫療”,有人看好,有人唱衰。這條“精準”之路究竟有多難走,如何才能走的長(cháng)遠而堅實(shí),今天我們采訪(fǎng)了中科院基因組所研究員胡松年教授,請跟隨我們傾聽(tīng)胡教授的觀(guān)點(diǎn)。
胡教授:早期我就是主要做組學(xué),從和華大一起參與人類(lèi)基因組計劃開(kāi)始,一直做相關(guān)的研究工作。但這兩年我們的工作重心開(kāi)始偏臨床應用方向了:首先政策層面講,從國家到我們院里,都希望科研人員更多的去做應用性研究,而我們本身也希望多做一些和老百姓生活健康更切實(shí)相關(guān)的應用性工作。所以這兩年的研究項目逐步調整到更多去和醫院、醫生來(lái)合作,做一些疾病相關(guān)的基因組分析。
隨著(zhù)二代測序技術(shù)的發(fā)展,精準醫療行業(yè)的興起,也會(huì )有來(lái)找到我們合作項目的企業(yè)。我們會(huì )選擇有自主研發(fā)實(shí)力的企業(yè)進(jìn)行深入合作,合作企業(yè)的產(chǎn)品或數據一定要有可信性、穩定性、持續性等特質(zhì),因為科研人員是很注重細節的,對合作企業(yè)要求會(huì )很高。
比如現在我們和益序醫療合作的“高血壓精準用藥基因隊列項目”,企業(yè)方自身具備二代測序的核心專(zhuān)利技術(shù)和平臺,而我們的優(yōu)勢是模型設計和生信分析,來(lái)與企業(yè)和市場(chǎng)共同打造高血壓專(zhuān)項數據庫。
目前整體的項目合作都很順利,即便是在項目研發(fā)的過(guò)程中偶爾出現些問(wèn)題,也能就產(chǎn)品優(yōu)化等問(wèn)題與益序公司有比較順暢的溝通和高效的協(xié)作。對此,組里的同仁也都非常認可,自然會(huì )投入較多的精力在這個(gè)項目上。
另外,從培養學(xué)生的角度講,我也希望讓他們能更早地體驗到,科研工作如何真正落地來(lái)和企業(yè)合作的這種需求和效率,在工作難度上是很有挑戰的。同時(shí)讓他們看到自己的科研成果的轉化應用和市場(chǎng)前景時(shí),也會(huì )增加他們學(xué)習和研究的樂(lè )趣。
轉化醫學(xué)網(wǎng):現在很多測序企業(yè)都在做
腫瘤靶向用
藥方面的產(chǎn)品,而高血壓屬于慢病,貌似不是“精準醫療”的主流方向,您是如何鎖定高血壓這個(gè)細分領(lǐng)域的呢?您能談?wù)剝烧叩牟町惷矗?/div>
不同個(gè)體對藥物的敏感性是有差異的
胡教授:之所以關(guān)注高血壓,首先是因為我本身就是高血壓患者,而且有過(guò)非常明顯的用藥不適應癥經(jīng)歷,所謂不痛不動(dòng)嘛!最開(kāi)始我吃硝苯地平的副作用非常嚴重,渾身肌肉酸痛;后來(lái)經(jīng)過(guò)一段時(shí)間的調藥過(guò)程,換成絡(luò )活喜后,馬上又沒(méi)事了。事實(shí)上,雖然這兩種藥在高血壓五大類(lèi)藥物的分類(lèi)上屬于同一類(lèi)型,但人體內負責代謝的酶和基因多態(tài)性相互作用的關(guān)系,卻造成了這種個(gè)體用藥反應上的表型差異;
其次,從臨床意義上講,目前90%左右的西藥在做藥物研發(fā)時(shí),其相關(guān)藥物代謝的研究脈絡(luò )是比較清楚的,所以要想做個(gè)體化精準醫療,用藥反應比明確病因更容易入手。
另外,從醫生的角度考慮,即便患者查出了基因的問(wèn)題,但到臨床上卻沒(méi)有對應的治療和用藥方案,那這樣不僅不能解決問(wèn)題,反而會(huì )增加醫生的負擔。
最后,從藥物層面講,我們對于大多數進(jìn)口西藥的經(jīng)驗不多,臨床應用就要從嘗試和探索起步。有醫生跟我講過(guò)伊立替康的例子,這種藥的副作用是嚴重的腹瀉,就出現過(guò)患者因為副作用死在馬桶上的。如此嚴重的副反應,如果用藥之前能了解個(gè)體之間的差異,通過(guò)劑量的調整,或尋找其他藥物的替代方案,就可以避免或減輕這樣的問(wèn)題。
因此,我們目前和企業(yè)合作的這個(gè)“高血壓精準用藥”的測序項目,就是想從藥物代謝入手,是可以給臨床醫生一些提示和參考的。幫助醫生了解患者的藥物代謝水平,梳理不同藥物的劑量選擇,就可以在多種治療方案中選擇相對風(fēng)險小且更對癥的方案。即避免給醫生造成困惑,也可以讓病人減輕痛苦,提高療效和依從性,不至延誤病情。
這正是組學(xué)數據在臨床應用中慢病優(yōu)于腫瘤的方面。
轉化醫學(xué)網(wǎng):您在構建數據庫的工作過(guò)程中,遇到哪些問(wèn)題和挑戰呢?
胡教授:目前對于中國人群來(lái)講,我們實(shí)在缺少垂直病種的基礎大數據,從基因多態(tài)性和突變頻率方面都是缺乏的。我們國家本身情況復雜,南方人和北方人,不同民族之間,在基礎頻率上都有差異。而目前絕大多數公司是基于歐美人群數據庫來(lái)選擇位點(diǎn),這樣的簡(jiǎn)單照搬是有風(fēng)險的。
比如我們以前做藥物代謝,其中腫瘤藥物伊立替康,在國內患者中能發(fā)現弱代謝的類(lèi)型,而歐美人群是沒(méi)有的。但有些國外要求檢測的位點(diǎn),在中國又是沒(méi)有頻率的。針對這個(gè)問(wèn)題,建立屬于中國人自己的數據庫顯得尤為重要,如果單純照搬復制不屬于中國人的頻率,檢測結果的可信度有多少?又會(huì )漏掉多少有問(wèn)題的位點(diǎn)?
轉化醫學(xué)網(wǎng):這個(gè)問(wèn)題應該是很多公司都面臨的問(wèn)題,您是如何解決的呢?
建立中國人自己的數據庫的價(jià)值和意義
從長(cháng)遠來(lái)看,我們一定要拿到中國人群的一手數據,就需要從測序入手,需要打造一個(gè)能長(cháng)期運作、持續積累的項目堅持下去,來(lái)分析中國人的基因型和高血壓相關(guān)藥物代謝之間的關(guān)聯(lián)性和個(gè)體差異。
這樣做下去,成本是很高,但到最后我們能沉淀下來(lái)的,是最終建立起中國人的高血壓組學(xué)數據庫,描繪出中國的高血壓基因地圖,這其中的社會(huì )意義和商業(yè)價(jià)值是不可估量、不可取代的。
其次,如果只是單純的基因數據的累計,并不能產(chǎn)生很大價(jià)值,需要相匹配的表型數據和臨床資料。這就意味著(zhù),想要建立一個(gè)垂直領(lǐng)域的組學(xué)數據庫,其中有巨量的工作需要做:
一方面,藥物代謝相關(guān)的知識結構是動(dòng)態(tài)的,需要長(cháng)期跟蹤,組學(xué)數據的特點(diǎn)是需要反復更新、挖掘及整理,并且需要持續而有效地與表型數據相關(guān)聯(lián);
另一方面,與患者生活、習慣及環(huán)境等相關(guān)的基本信息,也需要系統化的隨訪(fǎng)手段進(jìn)行收集和反饋。綜合這些信息,才能形成具有信息挖掘和分析價(jià)值的數據庫系統。
我們很高興找到和自己大方向的研究目標很貼切的合作伙伴,此次推出的“高血壓基因隊列數據庫”項目,通過(guò)商業(yè)化的市場(chǎng)運作,才有可能不斷累計最新的樣本和更全的數據,我們共同鎖定了一個(gè)非常長(cháng)遠的目標:三年內十萬(wàn)人免費檢測,百萬(wàn)人入組隨訪(fǎng),千萬(wàn)人臨床收益。因為只有當我們掌握了一定規模的中國人群數據,發(fā)現一定的中國人群特有的頻率,才能進(jìn)一步設計出在臨床應用上既快速又低成本且指示性強的檢測方案,才更有普適性。
轉化醫學(xué)網(wǎng):隨著(zhù)高通量測序技術(shù)的發(fā)展,將產(chǎn)出大量而龐雜的生物數據。您有一個(gè)研究領(lǐng)域是關(guān)于二代測序的數據產(chǎn)出和數據管理平臺的構建,您能介紹平臺構建方面的布局么?
胡教授:我們已經(jīng)建立二代測序大數據中心,將臨床的電子化數據和基因組數據進(jìn)行整合分析,形成系統的統計模型,給臨床醫生一個(gè)可直接應用的庫。
接下來(lái)我們在高血壓領(lǐng)域的數據建設,計劃會(huì )分成不同層次:比如科學(xué)上總會(huì )有新的位點(diǎn)的發(fā)現,這需要時(shí)時(shí)更新進(jìn)來(lái),數據庫這一層次的職能是服務(wù)于科研人員的,他們需要對更新的位點(diǎn)進(jìn)行分析研究;另一個(gè)層次是開(kāi)放給臨床醫生的端口,做到把測序數據和用藥數據關(guān)聯(lián)起來(lái),形成醫生可以直接提取的方案,提高醫療效率,降低醫療成本;再有就是病人層面的,要做到服務(wù)內容更個(gè)性化、兼具科普性與實(shí)用性,指導人們健康生活。
最后,可以預見(jiàn)的是,揭示并理解“人體與疾病、疾病與藥物、藥物與機體代謝”之間的關(guān)聯(lián)性與作用機理,或許將是實(shí)現“以人為本”個(gè)性化治療的必要前提。二代測序技術(shù)的快速發(fā)展與組學(xué)研究的持續開(kāi)展,或將成為我們未來(lái)做好個(gè)體化精準治療的必要途徑。