哥倫比亞大學(xué)病毒學(xué)教授A(yíng)mitKapoor領(lǐng)導的研究團隊開(kāi)發(fā)出一種新型且復雜的測序技術(shù),能應用于DNA和RNA片段。
以1974年至1980年間接受過(guò)輸血,且在輸血前和輸血后都留存有血液樣本為研究對象,運用“深度測序”技術(shù),研究團隊捕獲到已知病毒的核酸序列,并同時(shí)在兩個(gè)輸血后血液樣本中發(fā)現一種新病毒。
新病毒類(lèi)似于丙型肝炎
該病毒,屬于人類(lèi)pegivirus病毒屬,故將其命名為人類(lèi)hepegivirus1(HHpgV-1)病毒。雖然丙型肝炎病毒會(huì )導致嚴重的
肝功能損傷,但是HHpgV-1卻是無(wú)害的,研究顯示甚至是有益的。
Kapoor表示,許多人清楚人類(lèi)能夠與很多細菌共存,但是他們沒(méi)有意識到這同樣適用于一些病毒。相關(guān)研究成果于9月22日發(fā)表在《mBio》。
Kapoor和他的研究團隊擴大樣本量,但是沒(méi)有再發(fā)現HHpgV-1序列。
隨后,研究人員繼續對一批不同的存儲血液樣本(來(lái)自于106位有輸血史的血友病患者)分析,在超過(guò)兩份血液樣本中發(fā)現了HHpgV-1序列。但是沒(méi)有證據表明該序列與疾病有關(guān)聯(lián)。
研究人員無(wú)法從存儲血液中分離出病毒,也沒(méi)有辦法用細胞培養該病毒,但是它又確實(shí)存在。
阿爾伯達大學(xué)的病毒學(xué)家MichaelHoughton表示,盡管污染經(jīng)常顛覆新病毒的發(fā)現,但是HHpgV-1序列看起來(lái)很真實(shí)。新病毒的發(fā)現雖然存在很多未知,但是它的發(fā)現本身就闡明了深度測序技術(shù)用于檢測新病毒的強大功能。
新病毒是否與疾病相關(guān)?有待研究
舊金山血液系統研究所創(chuàng )辦人之一、美國政府血液安全咨詢(xún)組前成員、實(shí)驗病理學(xué)家MichaelBusch表示,血液存儲中心對HHpgV-1病毒采取行動(dòng)還為時(shí)尚早。他指出,很多血液制品,例如血漿,經(jīng)過(guò)過(guò)濾和失活過(guò)程,可能會(huì )消除HHpgV-1。
研究表明,感染艾滋病病毒的人能夠從hepegivirus病毒感染中受益,hepegivirus病毒由一部分HHpgV-1序列組成。他表示:“有明確證據表明,它減少了艾滋病毒的發(fā)病機制。”
Kapoor表示,現在面臨的主要挑戰是開(kāi)發(fā)一種抗體,能夠在大群體樣本中檢測是否感染有HHpgV-1。
基于該抗體,研究人員才能夠將存在HHpgV-1抗體的健康人群與對照組比較,最終獲得HHpgV-1是否與疾病相關(guān)聯(lián)的有力證據。
Busch表示,幾乎每年,科學(xué)家們都會(huì )發(fā)現一種新病毒,其中有一些病毒通過(guò)血液傳播。
研究人員開(kāi)始關(guān)注:這些不同的新型變異病毒來(lái)自哪里?它們是最近才出現還是已經(jīng)與人類(lèi)共存了很長(cháng)時(shí)間?
MBio.2015Sep22;6(5).pii:e01466-15.doi:10.1128/mBio.01466-15.
ViromeAnalysisofTransfusionRecipientsRevealsaNovelHumanVirusThatSharesGenomicFeatureswithHepacivirusesandPegiviruses.
Abstract
Toinvestigatethetran
smissionofnovelinfectiousagentsbybloodtransfusion,westudiedchangesintheviromecompositionofbloodtransfusionrecipientspre-andposttransfusion.Usingthisapproach,wedetectedandgeneticallycharacterizedanovelhumanvirus,humanhepegivirus1(HHpgV-1),thatsharesfeatureswithhepatitisCvirus(HCV)andhumanpegivirus(HPgV;formerlycalledGBvirusCorhepatitisGvirus).HCVandHPgVbelongtothegeneraHepacivirusandPegivirusofthefamilyFlaviviridae.HHpgV-1wasfoundinserumsamplesfromtwobloodtransfusionrecipientsandtwohemophiliapatientswhohadreceivedplasma-derivedclottingfactorconcentrates.Intheformer,theviruswasdetectedonlyintheposttransfusionsamples,indicatingblood-bornetransmission.Bothhemophiliacswerepersistentlyviremicoverperiodsofatleast201and1,981days.The5'untranslatedregion(UTR)ofHHpgV-1containedatypeIVinternalribosomeentrysite(IRES),structurallysimilartoalthoughhighlydivergentinsequencefromthatofHCVandotherhepaciviruses.However,phylogeneticanalysisofnonstructuralgenes(NS3andNS5B)showedthatHHpgV-1formsabranchwithinthepegiviruscladedistinctfromHPgVandhomologsinfectingothermammalianspecies.Incommonwithsomepegivirusvariantsinfectingrodentsandbats,theHHpgV-1genomeencodesashort,highlybasicproteinupstreamofE1,potentiallypossessingacore-likefunctioninpackagingRNAduringassembly.Identificationofthisnewhumanvirus,HHpgV-1,expandsourknowledgeoftherangeofgenomeconfigurationsofthesevirusesandmayleadtoareevaluationoftheoriginalcriteriabywhichthegeneraHepacivirusandPegivirusaredefined.
IMPORTANCE:
Morethan30millionbloodcomponentsaretransfusedannuallyintheUnitedStatesalone.Surveillanceforinfectiousagentsinthebloodsupplyiskeytoensuringthesafetyofthiscriticalresourceformedicineandpublichealth.Here,wereporttheidentificationofanewandhighlydiverseHCV/GBvirus(GBV)-likevirusfromhumanserumsamples.Thisnewvirus,humanhepegivirus1(HHpgV-1),wasfoundinserumsamplesfrombloodtransfusionrecipients,indicatingitspotentialfortransmissionviatransfusionproducts.Wealsofoundpersistentlong-termHHpgV-1viremiaintwohemophiliapatients.HHpgV-1isuniquebecauseitsharesgeneticsimilaritywithbothhighlypathogenicHCVandtheapparentlynonpathogenicHPgV(GBV-C).Ourresultsaddtothelistofhumanvirusesandprovidedatatodevelopreagentstostudyvirustransmissionanddiseaseassociationandforinterruptingvirustransmissionandnewhumaninfections.