臨床表現因病因不同有很大差異，一般包括吸收不良和原發(fā)疾病兩方面的癥狀。輕者僅有輕度腹瀉輕度貧血和體重減輕。嚴重者常有水瀉、脂肪瀉、腹脹、貧血、消瘦。脂肪吸收不良嚴重者可能發(fā)生軟骨病、夜盲甚至低鈣性抽搐。維生素K缺乏可出現皮膚黏膜出血。

　　貧血多由于維生素B12缺乏，屬大細胞貧血，有時(shí)因腸襻內潴留而致潰瘍時(shí)，可因失血出現小細胞貧血或混合性貧血。

　　低蛋白血癥常見(jiàn)，可出現營(yíng)養不良性水腫。

　　原發(fā)疾病如手術(shù)形成的盲襻或小腸狹窄者，有腹部不適、腹脹、腹瀉并伴有腹瀉前臍部痙攣性疼痛和貧血。在盲襻形成和細菌過(guò)度生長(cháng)之間，一般有一較長(cháng)的間隔期，短則數月，長(cháng)則數年。有時(shí)原發(fā)疾病甚至掩蓋了細菌過(guò)度生長(cháng)癥狀。如小腸克羅恩病引起的腸狹窄或瘺管，硬皮病或假性腸梗阻引起的腸運動(dòng)減弱。有些原發(fā)病引起的吸收不良和細菌過(guò)度生長(cháng)引起的吸收不良很難鑒別，如克羅恩病、放射性腸炎、短腸綜合征、淋巴瘤等。空腸憩室以老年人多見(jiàn)，憩室到細菌過(guò)度生長(cháng)時(shí)有多年的間隔期。開(kāi)始常無(wú)癥狀，以后才出現脂肪瀉和貧血。

　　診斷主要依靠小腸內容物培養或呼氣試驗。任何緩慢發(fā)生的腹瀉、脂肪瀉、體重減輕、大細胞性貧血患者，尤其是老年人或有腹部手術(shù)史的患者在鑒別診斷時(shí)要考慮小腸細菌過(guò)度生長(cháng)。X線(xiàn)胃腸造影示憩室、盲襻、瘺管等解剖或功能異常。纖維小腸鏡和活檢對病因診斷有一定幫助。