1.動(dòng)脈瘤樣骨囊腫 兩者在臨床、X線(xiàn)上都有相似之處，但動(dòng)脈瘤樣骨囊腫多為偏心性、具有中等度侵蝕性，且常可穿破骨皮質(zhì)包殼、其邊緣輪廓模糊不清，呈蟲(chóng)蛀狀，其骨皮質(zhì)常膨脹如氣球狀，可穿刺出新鮮血液，穿刺時(shí)常有血液搏動(dòng)感。而骨囊腫則為黃色或褐色液體。　
　2.骨巨細胞瘤 多見(jiàn)于20歲以上的成年患者，好發(fā)于股骨的遠端及脛骨近端，病變呈多房狀或泡沫狀，具有高度偏心性和膨脹性，有一定的侵蝕性，可穿透骨皮質(zhì)累及骨骺等特點(diǎn)。但股骨上端的骨巨細胞瘤與骨囊腫有時(shí)仍難以鑒別。　　
3.單發(fā)的骨纖維異樣增殖癥 兩者有時(shí)在臨床及X線(xiàn)表現上極相似，特別是纖維異樣增殖癥又無(wú)毛玻璃狀表現或絲瓜瓤狀改變而只呈囊狀膨脹改變時(shí)，很難鑒別，只是纖維異樣增殖癥病變范圍較廣泛，不一定呈中心性生長(cháng)，除骨端外，常侵及干骺端及骨干。　　
4.孤立性骨嗜酸性肉芽腫 該病病損范圍常較小，可發(fā)生于骨的任何部位，但以骨干部為多，常伴明顯的疼痛，白細胞計數和嗜酸粒細胞計數均可增高，X線(xiàn)影像其病損邊緣不如骨囊腫清晰，且多有骨膜反應。
5.非骨化性纖維瘤 多呈偏心性，距離骺板常有一定距離，病變范圍較小。
6.內生軟骨瘤 好發(fā)于手、足短管狀骨，X線(xiàn)片上可見(jiàn)病變的透明區內有鈣化斑點(diǎn)。