膿腫（25%）：
肛管直腸周?chē)撃[有2大類(lèi)：一類(lèi)與肛腺及肛瘺有關(guān)，稱(chēng)為原發(fā)性急性肛腺肌間瘺管性膿腫，簡(jiǎn)稱(chēng)瘺管性膿腫，較多見(jiàn);一類(lèi)與肛腺及肛瘺無(wú)關(guān)，稱(chēng)為急性非肛腺性非瘺管性膿腫，簡(jiǎn)稱(chēng)非瘺管性膿腫較少見(jiàn);肛瘺大多由前者發(fā)展而來(lái)。肛瘺多為一般化膿性感染所致，少數為特異性感染，如結核，克羅恩病，潰瘍性結腸炎。直腸肛管外傷繼發(fā)感染也可形成肛瘺，直腸肛管惡性腫瘤也可潰破成瘺管，但都很少見(jiàn)，與一般化膿性肛瘺有明顯區別。
性激素（30%）：
有人推測性激素的影響是肛瘺發(fā)生的主要原因，在青春期，人體自身的性激素開(kāi)始活躍，隨即一部分皮脂腺，特別是肛腺開(kāi)始發(fā)育增殖，男性較女性增生明顯，由于肛腺分泌旺盛，若加上肛腺排泄不暢或肛腺管阻滯，則易感染引起肛腺炎，這可解釋男性青壯年為何肛瘺發(fā)病率較高，而女性肛腺導管較直，不如男性彎曲，分泌物不易淤積，所以女性肛瘺發(fā)病率較低，人到老年，與其他皮脂腺普遍萎縮的同時(shí)，肛腺也隨之萎縮，故老年人肛瘺少見(jiàn)。
病原菌（15%）：
肛瘺有原發(fā)性?xún)瓤冢浌埽Ч芎屠^發(fā)性外口，內口即感染源的入口，多在肛竇內及其附近，后正中線(xiàn)的兩側多見(jiàn)，但也可在直腸下部或肛管的任何部位，瘺管有直有彎，少數有分支，外口即膿腫潰破處或切開(kāi)引流的部位，多位于肛管周?chē)つw，由于病原菌不斷經(jīng)內口進(jìn)入管道，加之管道迂曲行走于內，外括約肌附近，管壁由纖維組織構成，管內有肉芽組織，故經(jīng)久不愈。
一般單純性肛瘺只有1個(gè)內口和1個(gè)外口，這類(lèi)肛瘺臨床上最多見(jiàn)，若外口暫時(shí)封閉，局部引流不暢，則又逐漸發(fā)生感染，再次形成膿腫，封閉的外口可再穿破或在其他處形成另一外口(圖1)，如此反復發(fā)作，使病變范圍擴大或有時(shí)造成幾個(gè)外口，與內口相通，這種肛瘺稱(chēng)為復雜性肛瘺，即有1個(gè)內口與多個(gè)外口，但有人認為，復雜性肛瘺不應以外口的多少劃分，而是指主要瘺管累及肛管直腸環(huán)或環(huán)以上者，雖然這種肛瘺只有1個(gè)外口及1個(gè)內口，但治療比較復雜，故稱(chēng)為復雜性肛瘺，相反，有時(shí)肛瘺雖有多個(gè)外口，但治療并不復雜。