(一)治療
本病迄今尚無滿意的抗病毒治療藥物。阿昔洛韋對本病無效。更昔洛韋和膦甲酸鈉是兩種治療CMV感染的抗病毒藥物，已用于艾滋病患者、器官移植術后合并CMV感染患者的治療，或器官移植術后的預防性用藥，不過臨床使用后的效果尚未臻理想。
更昔洛韋是阿昔洛韋的衍生物，實驗室觀察可抑制巨細胞病毒DNA的合成。臨床試用于巨細胞病毒病患者的劑量為：緩慢靜脈滴注更昔洛韋2.5mg/kg體重，1次/8h，或5mg/kg體重，1次/12h，共2～3周。經(jīng)初步觀察，此藥有一定近期療效，但停藥后病毒又可重新復制活躍，故需用藥維持數(shù)月，甚至數(shù)年;由于此藥有一定毒性，例如使白細胞、血小板數(shù)減少等，故而往往難以堅持長期使用。對阿昔洛韋過敏者亦禁用此藥。此外，臨床上已發(fā)現(xiàn)一些CMV毒株對更昔洛韋表現(xiàn)出不同程度的耐藥性;而且，此藥對巨細胞病毒性肺炎無效。
膦甲酸鈉對巨細胞病毒DNA聚合酶和HIV病毒反轉(zhuǎn)錄酶均有抑制作用，故臨床試用于治療巨細胞病毒和HIV病毒合并感染的患者。
(二)預后
一般成人或兒童患者發(fā)生CMV臨床感染后大多預后良好。對機體處于免疫抑制狀態(tài)的患者，例如器官移植術受者、艾滋病患者、接受化療或放療的晚期癌癥患者，CMV感染可導致嚴重的臨床表現(xiàn)，或加速其死亡。CMV宮內(nèi)感染可導致流產(chǎn)或死產(chǎn)。