(一)治療
1.全身治療 包括柳氮磺吡啶(柳氮磺胺吡啶)、糖皮質(zhì)激素、硫唑嘌呤等，使用前應除外腸結核。鑒別困難者可先行2～3個(gè)月的抗結核治療。
SSZ為首選藥物，開(kāi)始每天2～3g，分4次口服，活動(dòng)期每天4～6g，維持量為每天2～3g。若用藥2周無(wú)效，可改用潑尼松每天30～40mg，分3～4次口服。嚴重者可用ACTH20～40U肌注或靜滴。有降結腸病變者，可并用氫化可的松保留灌腸。SSZ對早期病例有效，見(jiàn)效后應盡早減量，有腹腔內感染和敗血癥者禁用，有瘺管形成者慎用。長(cháng)期用藥能引起菌群失調，使手術(shù)病例增加，病死率也明顯上升。
硫唑嘌呤或巰嘌呤(6-巰基嘌呤)與糖皮質(zhì)激素合用，可減少后者的用量，但單獨使用不比SSZ和糖皮質(zhì)激素效果好。甲硝唑(滅滴靈)每天0.4～0.6g，分2～3次口服，對不太頑固的病例有效。
2.外科治療 需手術(shù)者達70%以上，急性者往往被誤診為急性闌尾炎而予手術(shù)，一旦發(fā)現是本病，就不能行闌尾切除，否則可形成腸瘺。手術(shù)的適應證包括不可逆性腸狹窄或腸梗阻、難治性腸瘺、腹內膿腫、穿孔、大出血、癌變和內科治療無(wú)效者。手術(shù)效果不如潰瘍性結腸炎好，復發(fā)率高達50%以上。手術(shù)后由于膽汁酸代謝變化及腸內細菌叢變動(dòng)，可引起有機酸代謝障礙、膽石癥、尿路結石或骨關(guān)節障礙，有時(shí)手術(shù)可成為直接或間接的死亡原因，故應慎重，切除范圍不宜超過(guò)3.0cm。
3.對癥治療 急性及活動(dòng)期宜安靜臥床，避免勞累和精神刺激，應給予高熱量、低脂肪、低渣和易消化的食物。補充鐵劑、各種維生素和電解質(zhì)(鈉、鉀、氯、鈣、鎂)，輸血、血漿、人血白蛋白和多種氨基酸制劑。靜脈給予高營(yíng)養療法有利于改善腸道功能與增強病人體質(zhì)。使年輕人發(fā)育不受影響。因廣泛回腸病變或切除后引起的腹瀉，可用考來(lái)烯胺(膽酪胺);脂肪吸收不良者可用中鏈三酰甘油;合并感染者可用抗生素，但應注意林可霉素和克林霉素(氯林可霉素)有引起潰瘍性結腸炎樣腸炎的可能。以上治療對早期病人可收到明顯效果。
(二)預后
2/3以上的急性病人在發(fā)作消退后不留痕跡。急性重癥病人可在數天內死亡。典型慢性病人可呈慢性間歇性發(fā)展，其危險性隨病程的延長(cháng)而增加。內科治療緩解率有限，病變不可能完全消失。大致能維持健康狀態(tài)者僅占10%～20%。有的病人盡管臨床表現近似健康人，但疾病仍在發(fā)展，而且多有一種或幾種并發(fā)癥。手術(shù)復發(fā)率高，5～10年內可有50%～80%的病人復發(fā)。結腸克羅恩病的結腸癌發(fā)生率比一般人高約20倍，小腸癌發(fā)生率約為0.3%。克羅恩病的病死率約為10%，死亡原因為腹膜炎和膿毒血癥。