由于心血管的病變，既是本病自身的癥狀，又是可致死亡的并發(fā)癥，在此節(jié)中將詳述其經(jīng)過情況，以期早期發(fā)現(xiàn)，及時適當治療。
1、冠狀動脈病變 根據(jù)日本1009例川崎病觀察結果，提示一過性冠狀動脈擴張占46%，冠狀動脈瘤占21%。應用二維超聲心動圖檢查發(fā)現(xiàn)冠狀動脈擴張在發(fā)病第3天即可出現(xiàn)，多數(shù)于3～6月內消退。發(fā)病第6天即可測得冠狀動脈瘤，第2～3周檢出率最高，第4周之后很少出現(xiàn)新的病變。冠狀動脈瘤的發(fā)生率為15～30%，臨床心肌炎的存在并不預示冠狀動脈受累。與冠狀動脈瘤有明確相關的一些危險因素包括發(fā)病年齡在1歲以內、男孩、持續(xù)發(fā)熱超過14天、貧血、白細胞總數(shù)在30×109/L以上、血沉超過100mm/h、C反應蛋白明顯升高，血漿白蛋白減低和發(fā)生體動脈瘤者。大多數(shù)冠狀動脈瘤呈自限性經(jīng)過，多數(shù)于1～2年內自行消退。
本病的冠狀動脈病變以累及其主干近端，左前降支最多見，其次為左回旋支少見。罕見孤立的遠端動脈瘤。一般將冠狀動脈病變嚴重的程度分為四度：
①正常（0度）：冠狀動脈無擴張。
②輕度（Ⅰ度）：瘤樣擴張明顯而局限，內徑＜4mm。
③中度（Ⅱ度）：可為單發(fā)、多發(fā)或廣泛性，內徑為4～7mm。
④重度（Ⅲ度）：巨瘤內徑≥8mm，多為廣泛性，累及1支以上。發(fā)生率約為5%，預后不良。故有冠狀動脈病變者應密切隨訪定期復查超聲心動圖。通常在發(fā)病4周內每周檢查1次，以后2月、半年復查，然后根據(jù)病變程度至少每年復查一次。對有癥狀的病人及冠狀動脈嚴重受累者應作冠狀動脈造影檢查。造影檢查可準確評估冠狀動脈狹窄及閉塞程度及遠端病變。因導致端堵塞血管腔可發(fā)生一過性心肌缺血，心室顫動等嚴重并發(fā)癥。冠狀動脈造影的適應證為：
①有心肌缺血癥狀。
②持續(xù)心臟瓣膜病變。
③X-線平片示冠狀動脈鈣化。
④超聲心動圖顯示持久的冠狀動脈瘤。
2、膽囊積液　多出現(xiàn)于亞急性期，可發(fā)生嚴重腹痛，腹脹及黃疸。在右上腹可摸到腫塊，腹部超聲檢查可以證實。大多自然痊愈，偶可并發(fā)麻痹性腸梗阻或腸道出血。
3、關節(jié)炎或關節(jié)痛　發(fā)生于急性期或亞急性期，大小關節(jié)均可受累，約見于20%病例，隨病情好轉而痊愈。
4、神經(jīng)系統(tǒng)改變　急性期包括無菌性腦脊髓膜炎、面神經(jīng)麻痹、聽力喪失、急性腦病和高熱驚厥等，是由于血管炎引起，臨床多見，恢復較快，預后良好。其中無菌性腦脊髓膜炎最常見，發(fā)生率約25%。多發(fā)生于病初2周內。部分患兒顱壓增高，表現(xiàn)前囪隆起。少數(shù)患兒頸項強直，可有嗜睡、雙眼凝視、昏迷等意識障礙。腦脊液淋巴細胞輕度增多，糖、氯化物正常，蛋白會計師絕大多數(shù)正常。臨床癥狀多在數(shù)日內消失，面神經(jīng)麻痹多見于嚴重患者，常為外周性麻痹，可能是由于血管炎性反應波及面神經(jīng)，或鄰近部位血管病變，如動脈瘤形成、動脈擴張等，一過性壓迫面神經(jīng)所致?；謴推谟捎诖竽X中動脈狹窄或閉塞引起的肢體癱瘓，則容易遺留后遺癥，較為少見。
5、其他并發(fā)癥 肺血管炎在X線胸片顯示肺紋一增多或有片狀陰影，偶有發(fā)生肺梗塞。急性期可有尿道炎，尿沉渣可見白細胞增多及輕度蛋白尿。虹膜睫狀體炎較少見。約2%患者發(fā)生體動脈瘤，以腋、髂動脈多見。偶見指趾壞疽。