臨床表現典型的瘧疾，診斷不難，對于占1/3以上的所謂非典型病例，須與以發(fā)熱、脾大和肝大為特點(diǎn)的其他疾病相鑒別，以免貽誤治療，擴散瘧疾，或忽視了與瘧疾并存的其他疾病。

　　1.急性血吸蟲(chóng)病 有血吸蟲(chóng)病流行區的疫水接觸史和尾蚴皮炎史，常見(jiàn)腹瀉和黏血便等消化系統癥狀和干咳等，與瘧疾不同的是肝大者占的90%以上，以左葉較顯著(zhù)，白細胞數增加，嗜酸粒細胞增多，尾蚴膜反應、環(huán)卵沉淀試驗或大便孵化陽(yáng)性。

　　2.絲蟲(chóng)病 多數有既往發(fā)作史，白細胞和嗜酸粒細胞增多，無(wú)貧血和脾大，血微比蚴多為陽(yáng)性。

　　3.黑熱病 有黑熱病流行區居住史。發(fā)熱一般不規則，后期可發(fā)展為全血細胞減少，有鼻出血或齒齦出血等癥，肝脾大，骨髓穿刺可查到利杜體。

　　4.阿米巴肝膿腫 肝臟明顯腫大和疼痛，無(wú)脾大，熱型不規則，白細胞顯著(zhù)增多，以中性粒細胞為主，超聲波及X線(xiàn)檢查可發(fā)現膿腫。

　　5.傷寒 發(fā)熱呈稽留熱，有玫瑰疹、腹脹等胃腸道癥狀和其他全身中毒癥狀等。血、骨髓、大便等細菌培養和傷寒血清凝集反應陽(yáng)性。

　　6.敗血癥 體溫不規則，白細胞及中性粒細胞顯著(zhù)增多，一般可發(fā)現感染原因，血或骨髓細菌培養陽(yáng)性。

　　7.布氏菌病 發(fā)熱呈周期性，一般癥狀不重。以后可見(jiàn)一系列神經(jīng)癥狀，可進(jìn)行皮內和血清學(xué)試驗。

　　8.鉤端螺旋體病 體溫多呈持續熱或弛張熱，有上眼結膜充血、腓腸肌痛、淋巴結腫痛、皮膚黏膜出血、肝功能損害和肺部癥狀等。可進(jìn)行血清免疫學(xué)試驗和檢查鉤端螺旋體確診，青霉素有效。

　　9.急性腎盂腎炎 發(fā)熱不規則，有腰酸、尿頻、尿急及尿痛等。尿檢查見(jiàn)紅、白細胞及蛋白，細菌培養陽(yáng)性。但無(wú)原發(fā)病瘧疾的臨床癥狀和病史,可資鑒別。