全垂體功能減遲癥還必須和一系列其他疾病相鑒別，其中有：神經(jīng)性厭食、慢性肝病以及營養(yǎng)不良性肌強(qiáng)直。神經(jīng)性厭食(一般見之于女性)的臨床征象往往具有診斷意義。這些征象包括惡病質(zhì)、對食物和身體形象具有異常的意念以及雖然經(jīng)閉但仍保持其第二性征。一般說來，患有神經(jīng)性厭食的病人的GH和皮質(zhì)醇的基礎(chǔ)水平也易增高的。因為下丘腦病損能夠擾亂控制食欲的中樞，所以對疑診病人中進(jìn)行蝶鞍X線檢查也不是毫無道理的。(另見“神經(jīng)性厭食”)。患有酒精性肝病或血色素沉著癥的男子，只要其睪丸萎縮伴有全身無力，便往往被懷疑為垂體功能減退癥。但是在絕大多數(shù)場合，利用實驗室試驗是可以識別其基礎(chǔ)性的原發(fā)疾病，也能夠排除垂體功能減退癥。思這些疾病的病人死后做尸體解剖時很少能夠見到其有過廣泛的垂體功能失調(diào)的形態(tài)學(xué)證據(jù)。營養(yǎng)不良性肌強(qiáng)直患者的主訴是進(jìn)行性肌無力，過早的禿頂和白內(nèi)障以及足以說明早衰的臉部征象：男子可能出現(xiàn)睪丸萎縮。內(nèi)分泌檢驗可以排除垂體功能減退癥。