血栓栓塞性疾病的治療方法包括藥物、介入治療和外科手術(shù)，臨床醫師應全面掌握三種方法，預防與治療相結合，使患者得到最大的獲益。。
1、動(dòng)脈血栓的防治
對于動(dòng)脈血栓形成，實(shí)際上腦卒中、心肌梗死和外周血管閉塞是同一類(lèi)疾病，具有相似的防治策略，使用的手段也大同小異。因此應整合和重組醫療資源，積極倡導成立血管血管疾病防治中心，讓患者得到最優(yōu)化的預防、診斷、治療和康復，讓醫生、設備和藥品發(fā)揮最大的作用，提高效率，提升防治水平。
通過(guò)防治高血壓、血脂紊亂和糖尿病等危險因素，通過(guò)改變生活方式和藥物干預等措施控制這些危險因素，延緩或者避免動(dòng)脈粥樣硬化病變的發(fā)生和發(fā)展。即便有了病變，也可以通過(guò)行為和藥物干預避免斑塊破裂，抗栓治療預防斑塊破裂的基礎上形成血栓，預防出現血管事件。對已經(jīng)發(fā)生血管事件的患者是要通過(guò)積極干預防止再發(fā)生類(lèi)似的血管事件，可終身服用小劑量阿司匹林、他汀類(lèi)調脂藥物，可以穩定斑塊和防止再發(fā)生血管事件。
對于導致血流動(dòng)力學(xué)改變引起臟器灌注不足癥狀的動(dòng)脈粥樣硬化病變，應選擇合適的介入治療或外科手術(shù)，恢復官腔再通，預防血管事件的發(fā)生。
2、靜脈血栓栓塞的防治
靜脈系統的血栓形成應著(zhù)重避免引起血流減慢的因素，如手術(shù)患者盡早離床活動(dòng)，長(cháng)時(shí)間飛行旅行注意定期活動(dòng)下肢，大手術(shù)或者嚴重創(chuàng )傷患者術(shù)后使用抗血栓藥物等。對于住院患者，應常規進(jìn)行危險評估，根據危險分層情況，使用預先準備好的預防方案進(jìn)行預防處理。靜脈血栓栓塞的預防措施包括藥物和器械兩類(lèi)。主要藥物是低分子肝素、普通肝素和華法林，器械方法包括間歇充氣壓力泵（IPC）和梯度壓力彈力襪（GCS），兩者可聯(lián)合應用，具體適應癥和用法請參見(jiàn)2004年美國胸科醫師學(xué)會(huì )（ACCP）的抗栓指南。
DVT治療的目的是防止血栓延展和發(fā)生肺栓塞，防止血栓復發(fā)，防止發(fā)生血栓后綜合征，抗凝治療是主線(xiàn)。溶栓應僅限于那些巨大的髂股DVT，有繼發(fā)于靜脈閉塞肢體壞疽風(fēng)險的患者。腔靜脈濾器適用于下肢靜脈近端血栓，抗凝治療禁忌或有并發(fā)癥；經(jīng)充分抗凝反復發(fā)作肺栓塞；行肺動(dòng)脈血栓切除術(shù)或肺動(dòng)脈血栓內膜剝脫術(shù)的患者。手術(shù)和介入治療僅限于可能發(fā)生靜脈性壞疽，為了挽救肢體的情況。肺栓塞的預防同深靜脈血栓形成。肺栓塞治療的主要目的迅速降低肺動(dòng)脈壓力和肺血管阻力，挽救瀕臨死亡的患者，肺栓塞的溶栓治療僅限于有血液動(dòng)力學(xué)不穩定的患者，應及早開(kāi)始和大劑量快速溶栓。
抗凝是靜脈血栓栓塞的基本治療措施，低分子肝素和華法林同時(shí)開(kāi)始應用，國際標準化比值達到（INR）2.0-3.0之間連續兩天停用低分子肝素，繼續使用華法林。除積極治療外，在出院后必須定期隨訪(fǎng)，在監測血液的情況下服用一段時(shí)間的華法林，以防血栓栓塞的復發(fā)。
3、動(dòng)脈栓塞的防治
對已經(jīng)發(fā)生的動(dòng)脈栓塞，外科手術(shù)取栓使最有效的治療方法，溶栓治療和介入治療的效果都不肯定。
動(dòng)脈栓塞的主要原因是房顫，對房顫患者預防動(dòng)脈栓塞的最重要辦法是口服華法林，規范的抗凝治療可降低腦卒中的風(fēng)險68%，降低死亡23%，阿司匹林也有效，但效果明顯不及華法林。
華法林和肝素（包括低分子肝素）是抗凝藥物，其作用在于防止新血栓形成，對于已經(jīng)存在的血栓，兩類(lèi)藥物都沒(méi)有直接的溶解作用，但機體自身具有很強的溶解和清除自身血栓的能力。越是新鮮或者新形成的血栓越容易脫落造成栓塞，抑制新的血栓形成也就防止深靜脈血栓形成或者房顫患者發(fā)生肺栓塞或者腦栓塞的可能性。