本病的潛伏期為2～21天，但多在7～14天。病人突然出現(xiàn)發(fā)熱、寒戰(zhàn)、頭痛、肌痛、疲乏與食欲減退。隨著疾病進展，出現(xiàn)嘔吐、腹瀉、排血樣便。可有腹痛、胸痛、咽痛。發(fā)病數(shù)天后可出現(xiàn)斑丘疹樣皮疹。病人出現(xiàn)凝血障礙，注射部位可出血不止，皮膚、胃腸道及其他內(nèi)臟亦可出血。嚴重出血可導致休克及死亡。
本病的臨床表現(xiàn)與其他病毒性出血熱相似，確定診斷須靠病原學或血清學診斷。用實驗室方法從病人或可疑受感染者血液或其他臨床標本中檢測出埃博拉病毒的抗原、抗體或核酸或用病毒分離方法分離出此病毒即可診斷。但因本病傳染性強，作診斷檢測的實驗室必須具備嚴格的防護設(shè)施的相應的措施。目前在非洲疫區(qū)使用的實驗室檢查方法有檢測特異性IgM和IgG抗體的ELISA和Western印跡試驗。也有人用反轉(zhuǎn)錄PCR方法檢測該病毒的RNA。Saijo等近期報告，應用以基因工程方法制備的埃博拉病毒核心蛋白質(zhì)羧基段110和102個氨基酸的肽為抗原，開發(fā)出檢測埃博拉病毒IgG抗體的ELISA方法，具有很高的特異性和敏感性，對埃博拉病毒和馬爾堡病毒感染具有很強的診斷意義。

根據(jù)流行病學的地區(qū)分布等特征、臨床表現(xiàn)、實驗室檢測的陽性結(jié)果進行診斷。在鑒別診斷中須與非洲出血性疾病如馬爾堡病、裂谷熱、拉沙熱、克里米亞-剛果出血熱及黃熱病等區(qū)別。主要依據(jù)病原學檢測。