致病性自生生活阿米巴性角膜炎患者多為年輕的健康人，男女比例均等，多數有角膜接觸鏡配戴史或眼外傷史。絕大多數為單眼受累，個(gè)別患者也可雙眼發(fā)病，起病一般比較緩慢。炎癥早期主要表現為角膜上皮的不規則，上皮粗糙或反復上皮糜爛，有時(shí)可表現為假樹(shù)枝狀改變。患者常有明顯的眼痛，其程度往往超出體征，形成“癥狀與體征分離”的現象。
隨著(zhù)病情發(fā)展，炎癥逐漸侵及基質(zhì)層，形成角膜前基質(zhì)層的斑狀、半環(huán)狀或環(huán)狀浸潤。有些病變類(lèi)似于盤(pán)狀角膜炎的改變，部分患者可有放射狀角膜神經(jīng)炎。
如未得到及時(shí)診斷與治療，角膜浸潤很快發(fā)展成角膜潰瘍、基質(zhì)膿腫，并有衛星灶形成和前房積膿，嚴重者發(fā)生角膜壞死穿孔。如果角膜潰瘍累及到角膜緣，常導致角膜緣炎，甚至鞏膜炎。
嚴重的病例中，有20%以上發(fā)生白內障，尤其在病情遷延、角膜移植術(shù)后、以及長(cháng)期滴用過(guò)糖皮質(zhì)激素的病例。
棘阿米巴原蟲(chóng)可以與細菌、真菌及病毒混合感染。混合感染的細菌主要有表皮葡萄球菌、金黃色葡萄球菌、鏈球菌屬及短棒菌苗。
棘阿米巴角膜炎的診斷主要依靠臨床表現和實(shí)驗室檢查，角膜刮片進(jìn)行棘阿米巴原蟲(chóng)培養是比較常用的一種檢查方法。

致病性自生生活阿米巴性角膜炎，早期須與單孢病毒性角膜炎的上皮病變型相鑒別。此時(shí)誤診率較高，對初次發(fā)病的上皮性病變、有遷延不愈傾向，同時(shí)有外傷或角膜接觸鏡配戴史的患者要高度懷疑，并及時(shí)行角膜刮片細胞學(xué)檢查，有利于鑒別診斷。當角膜基質(zhì)浸潤及潰瘍形成時(shí)，要與單孢病毒性盤(pán)狀角膜炎、細菌及真菌性角膜炎相鑒別，眼部劇烈的疼痛史或放射狀角膜神經(jīng)炎的出現都有助于鑒別診斷。近年來(lái)角膜共焦顯微鏡的應用，為棘阿米巴性角膜炎的早期快速診斷提供了新的手段。通過(guò)角膜共焦顯微鏡，可在活體角膜中觀(guān)察到棘阿米巴包囊，有助于臨床診斷。但共焦顯微鏡檢查陰性，并不能完全否定臨床診斷。