由于腸道病毒血清型過(guò)多(有近70個(gè)型)，因此未能制成有效可行的疫苗，預防措施的效果遠遜于脊髓灰質(zhì)炎。
1.管理傳染源 患者應予隔離2周，管理傳染源的重點(diǎn)應放在托幼機構和產(chǎn)房;懷孕婦女患有腸道病毒性疾病者，對新生兒有很大威脅，應注意隔離。
2.切斷傳播途徑 加強飲食管理和個(gè)人衛生，不吃臟水污染過(guò)或蒼蠅爬過(guò)的食物，避免在污水中游泳。自來(lái)水宜煮沸后飲用。因患者口咽部可能排出病毒，接觸這些患者時(shí)應戴口罩。流行期間，減少集體活動(dòng)。患者糞便需加20%生石灰和含氯石灰混懸液等量，混合后作用2h，才可排入下水道。
3.保護易感者 接觸患者的嬰幼兒可肌內注射丙種球蛋白3～6ml，以預防感染，對年長(cháng)兒及青年人不必采用。口服脊髓灰質(zhì)炎疫苗OPV也可試用，利用其在腸道內的干擾作用，有可能控制腦膜炎的流行。應用柯薩奇B組病毒制成的疫苗于高危人群，有可能預防嬰兒心肌炎的流行。